ПОДХОД "КАНДИДАТНЫХ ГЕНОВ" И МЕТААНАЛИЗ ПРИ ИДЕНТИФИКАЦИИ АЛЛЕЛЕЙ ГРУППЫ РИСКА
В последние 15 лет наблюдается экспоненциальный рост числа исследований, посвященных выявлению генов-кандидатов для возникновения ИБС. Однако отсутствие воспроизводимости данных по аллелям кандидатных генов и их связи с риском ИБС заронило сомнения среди представителей эпидемиологической генетики. Большая их часть относится все же к исследованиям какой-нибудь одной однонуклеотидной замены, которая может оказаться простым полиморфизмом и ничего не означать [129]. В настоящее время подобные исследования сводятся к так называемому метаанализу, анализирующему ту или иную нуклеотидную замену во многих популяциях. За последние годы опубликовано несколько метаанализов (табл. 9.9).
Таблица 9.9. Список генных вариантов с опубликованными результатами по метаанализу риска развития ишемической болезни сердца. При нескольких проведенных анализах на одном и том же генном варианте показана только ссылка на последние результаты
Один из наиболее изученных генов кодирует плазменный аполипопротеин E, который называется ApoE. Наиболее распространенный ApoE-аллель - Е3. Также существуют два других варианта - Е4 и Е2 (распространенность данных аллелей среди жителей Европы составляет 0,15 и 0,07 соответственно). Изменения последовательности ДНК этого гена затрагивают две заряженные аминокислоты, которые влияют на плазменный клиренс белка и богатых ХС липопротеидов, несущих этот белок. Как следствие (рис. 9.14), существует связь данных аллелей с уровенем плазменных липидов (аллель E2 снижает их концентрацию, а Е4 - повышает), это приводит к тому, что алелль Е2 несколько снижает риск развития ИБС, а Е4 незначительно его повышает [130].
Таблица 9.9. Список генных вариантов с опубликованными результатами по метаанализу риска развития ишемической болезни сердца. При нескольких проведенных анализах на одном и том же генном варианте показана только ссылка на последние результаты
Ген (варианты) |
Генотип, ассоциированный с риском |
Количество исследований (количество случаев) |
Эффект (95% ДИ) |
Ссылка |
AT1R (1166A gt;C) |
C+ |
27 (10,180) |
1,13 (1,041,23) |
Ntzani et al., 2007 [137] |
MMP3 (5A/6A) |
5A+ |
8 (3655) |
1,26 (1,111,4) |
Abilleira et al., 2006 [138] |
MMP9 (1562C gt;T) |
T+ |
5 (4817) |
1,11 (11,3) |
Abilleira et al., 2006 [138] |
ApoE ?2, ?3, ?4 |
?2+ ?4+ |
121 (37,850) |
0,8 (0,700,90) 1,06 (0,991,13) |
Bennet et al., 2007 [130] |
LTA (10G gt;A) |
A+ |
7 (10,996) |
1,09 (1,021,16) |
Clarke et al., 2006 [139] |
LPL (N291S) |
S+ |
21 (1203) |
1,48 (1,092) |
Hu et al., 2006 [140] |
AGT (T174M) (M235T) |
M+ T+ |
43 (13478) |
1,07 (0,931,22) 1,11 (1,031,19) |
Xu et al., 2007 [141] |
F5 (1691G gt;A) F7 (10976G gt;A) F2 (20210G gt;A) PAI1 (4G/5G) GP1A (807C gt;T) GP1BA (5T gt;C) GP3A (1565 C gt;T) |
A+ A+ A+ 5G+ T+ C+ T+ |
60 (15,704) 24 (7444) 40 (11,625) 37 (11,763) 15 (6414) 14 (6652) 43 (16,984) |
1,17 (1,081,28) 0,97 (0,911,04) 1,31 (1,121,52) 1,06 (1,021,1) (0,971,08) 1,05 (0,961,13) (0,981,07) |
Ye et al., 2006 [142] |
IL6 (174G gt;C) |
C+ |
8 (4799) |
1,12 (0,971,29) |
Sie et al., 2006 [143] |
F13 (V34L) |
L+ |
12 (8743) |
0,79 (0,660,93) |
Shafey et al., 2007 [144] |
Один из наиболее изученных генов кодирует плазменный аполипопротеин E, который называется ApoE. Наиболее распространенный ApoE-аллель - Е3. Также существуют два других варианта - Е4 и Е2 (распространенность данных аллелей среди жителей Европы составляет 0,15 и 0,07 соответственно). Изменения последовательности ДНК этого гена затрагивают две заряженные аминокислоты, которые влияют на плазменный клиренс белка и богатых ХС липопротеидов, несущих этот белок. Как следствие (рис. 9.14), существует связь данных аллелей с уровенем плазменных липидов (аллель E2 снижает их концентрацию, а Е4 - повышает), это приводит к тому, что алелль Е2 несколько снижает риск развития ИБС, а Е4 незначительно его повышает [130].
Источник: Кэмм А. Джон, Люшер Томас Ф., Серруис П.В., «Болезни сердца и сосудов.Часть 2 (Главы 6-10)» 2011
А так же в разделе « ПОДХОД "КАНДИДАТНЫХ ГЕНОВ" И МЕТААНАЛИЗ ПРИ ИДЕНТИФИКАЦИИ АЛЛЕЛЕЙ ГРУППЫ РИСКА »
- ВВЕДЕНИЕ
- МОНОГЕННАЯ ПРИЧИНА ИШЕМИЧЕСКОЙ БОЛЕЗНИ СЕРДЦА: СЕМЕЙНАЯ ГИПЕРХОЛЕСТЕРИНЕМИЯ
- ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ТЕСТЫ У ПАЦИЕНТОВ С СЕМЕЙНОЙ ГИПЕРХОЛЕСТЕРИНЕМИЕЙ
- ПОЛИГЕННЫЕ ФОРМЫ ИШЕМИЧЕСКОЙ БОЛЕЗНИ СЕРДЦА: ПРИНЦИПЫ
- ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ДЕТЕРМИНАНТЫ ИШЕМИЧЕСКОЙ БОЛЕЗНИ СЕРДЦА
- ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ ГЕНОМА С ФАКТОРАМИ ОКРУЖАЮЩЕЙ СРЕДЫ И ПРОГНОЗИРОВАНИЕ РИСКА
- ИСПОЛЬЗОВАНИЕ ДАННЫХ, ПОЛУЧЕННЫХ ПРИ МЕТААНАЛИЗЕ
- НОВЫЕ ГЕНЫ, АССОЦИИРОВАННЫЕ С ИШЕМИЧЕСКОЙ БОЛЕЗНЬЮ СЕРДЦА