ПОДХОД "КАНДИДАТНЫХ ГЕНОВ" И МЕТААНАЛИЗ ПРИ ИДЕНТИФИКАЦИИ АЛЛЕЛЕЙ ГРУППЫ РИСКА

  В последние 15 лет наблюдается экспоненциальный рост числа исследований, посвященных выявлению генов-кандидатов для возникновения ИБС. Однако отсутствие воспроизводимости данных по аллелям кандидатных генов и их связи с риском ИБС заронило сомнения среди представителей эпидемиологической генетики. Большая их часть относится все же к исследованиям какой-нибудь одной однонуклеотидной замены, которая может оказаться простым полиморфизмом и ничего не означать [129]. В настоящее время подобные исследования сводятся к так называемому метаанализу, анализирующему ту или иную нуклеотидную замену во многих популяциях. За последние годы опубликовано несколько метаанализов (табл. 9.9).
Таблица 9.9. Список генных вариантов с опубликованными результатами по метаанализу риска развития ишемической болезни сердца. При нескольких проведенных анализах на одном и том же генном варианте показана только ссылка на последние результаты

Ген
(варианты)

Генотип,
ассоциированный с риском

Количество исследований (количество случаев)

Эффект (95% ДИ)

Ссылка

AT1R (1166A gt;C)

C+

27 (10,180)

1,13 (1,041,23)

Ntzani et al., 2007 [137]

MMP3 (5A/6A)

5A+

8 (3655)

1,26 (1,111,4)

Abilleira et al., 2006 [138]

MMP9 (1562C gt;T)

T+

5 (4817)

1,11 (11,3)

Abilleira et al., 2006 [138]

ApoE ?2, ?3, ?4

?2+
?4+

121 (37,850)

0,8 (0,700,90)
1,06 (0,991,13)

Bennet et al., 2007 [130]

LTA (10G gt;A)

A+

7 (10,996)

1,09 (1,021,16)

Clarke et al., 2006 [139]

LPL (N291S)

S+

21 (1203)

1,48 (1,092)

Hu et al., 2006 [140]

AGT (T174M) (M235T)

M+
T+

43 (13478)

1,07 (0,931,22)
1,11 (1,031,19)

Xu et al., 2007 [141]

F5 (1691G gt;A) F7
(10976G gt;A) F2
(20210G gt;A)
PAI1 (4G/5G)
GP1A (807C gt;T)
GP1BA (5T gt;C)
GP3A (1565 C gt;T)

A+
A+
A+
5G+
T+
C+
T+

60 (15,704) 24 (7444) 40 (11,625) 37 (11,763) 15 (6414) 14 (6652) 43 (16,984)

1,17 (1,081,28)
0,97 (0,911,04)
1,31 (1,121,52)
1,06 (1,021,1)
(0,971,08)
1,05 (0,961,13)
(0,981,07)

Ye et al., 2006 [142]

IL6 (174G gt;C)

C+

8 (4799)

1,12 (0,971,29)

Sie et al., 2006 [143]

F13 (V34L)

L+

12 (8743)

0,79 (0,660,93)

Shafey et al., 2007 [144]

Один из наиболее изученных генов кодирует плазменный аполипопротеин E, который называется ApoE. Наиболее распространенный ApoE-аллель - Е3. Также существуют два других варианта - Е4 и Е2 (распространенность данных аллелей среди жителей Европы составляет 0,15 и 0,07 соответственно). Изменения последовательности ДНК этого гена затрагивают две заряженные аминокислоты, которые влияют на плазменный клиренс белка и богатых ХС липопротеидов, несущих этот белок. Как следствие (рис. 9.14), существует связь данных аллелей с уровенем плазменных липидов (аллель E2 снижает их концентрацию, а Е4 - повышает), это приводит к тому, что алелль Е2 несколько снижает риск развития ИБС, а Е4 незначительно его повышает [130].

Источник: Кэмм А. Джон, Люшер Томас Ф., Серруис П.В., «Болезни сердца и сосудов.Часть 2 (Главы 6-10)» 2011

А так же в разделе «  ПОДХОД "КАНДИДАТНЫХ ГЕНОВ" И МЕТААНАЛИЗ ПРИ ИДЕНТИФИКАЦИИ АЛЛЕЛЕЙ ГРУППЫ РИСКА »