На сегодня главным критерием в таксономии вирусов являются: 1) тип и структура вирусного генома 2) стратегия репликации вируса 3) структура вириона. Полное или частичное секвенирование вирусного генома увеличивает таксономическую информацию и очень часто используется с целью идентификации вируса. Сведения о нуклеотидной последовательности для всех таксономических групп вирусов имеются в опубликованной базе данных (Генбанк, Национального Центра биотехнологической информации, Национальной медицинской лаборатории, Национального Института здоровья, Бетезда, Мериленд, США). Это достижение в большинстве случаев укорачивает таксономическую идентификацию, хотя традиционные методы все еще часто используются по экономическим соображениям. Универсальная система таксономии вирусов включает несколько уровней: порядок, семейство, подсемейство, род и вид. Патогенные вирусы позвоночных (человека и животных) в соответствии с современной системой классификации вирусов объединены в 2 (Mononegavirales и Nidovirales) порядка и 28 семейств, из которых 10 являются ДНК-вирусами и 18 РНК-вирусами.
Семейство |
Подсемейство |
Род |
Типовой вид |
ДНК-вирусы |
|||
Вирусы оспы |
Вирусы |
Ортопоксвирусы |
Вирус вакцины |
|
ОСПЫ хордовых |
Парапоксвирусы |
Вирус орф (контагиозного пустулезного дерматита овец-эктимы) |
|
|
Авипоксвирусы |
Вирус оспы кур |
|
|
Лепорипоксивирусы |
Вирус миксомы кроликов |
|
|
Суипоксвирусы |
Вирус оспы свиней |
|
|
Каприпоксвирусы |
Вирус оспы овец |
|
|
Ятапоксивирусы |
Вирус опухолей обезьян Яба |
|
|
Молюсцивирусы |
Вирус контагиозного моллюска |
Асфаро- вирусы |
|
Асфивирусы |
Вирус африканской чумы свиней |
Иридовирусы |
|
Рановирусы |
Вирус лягушек 3 |
|
|
Лимфоцистивирусы |
Вирус лимфоцитоза рыб |
Герпесвирусы |
Альфагерпес- |
Простые герпесвирусы |
Вирусы герпеса человека 1 |
|
вирусы |
Варицелловирусы |
Вирусы герпеса человека 3 |
|
|
Вирусы, подобные вирусу болезни Марека |
Вирус болезни Марека |
|
|
Вирусы, подобные вирусу ларинготрахеита птиц |
Герпесвирус птиц 1 |
|
Бетагерпес- |
Цитомегаловирусы |
Герпесвирус человека 5 |
|
вирусы |
Муромегаловирусы |
Цитомегаловирус мышей 1 |
|
|
Розеоловирусы |
Герпесвирус человека 6 |
|
Гаммагерпес- |
Лимфокриптовирусы |
Герпесвирус человека 4 и* |
|
вирусы |
Радиновирусы |
Герпесвирус обезьян 2 |
|
Герпесподоб- ные вирусы |
Герпесподобные вирусы |
L |
Аденовирусы |
Мастаде- вирусы |
|
Аденовирус человека 2 |
|
Авиадено- вирус |
|
Аденовирус птиц 1 |
|
Неклассифи цированные аденовирусы |
! |
|
Полиома- вирусы |
|
Полиомавирусы |
Вирус обезьян SV40 |
Семейство |
Подсемейство |
Род |
Типовой вид |
Папиллома- вирусы |
|
Папиломавирусы |
Вирус папилломы кроликов |
Цирковирусы |
|
Цирковирусы |
Вирус анемии цыплят |
Парвовирусы |
Парвовирусы |
Парвовирусы |
Мелкий вирус мышей |
|
|
Эритровирусы |
Вирус В19 |
|
|
Депендовирусы |
Адено-ассоциированные вирусы человека и обезьян 2 |
Гепадно- |
|
Ортогепаднавирусы |
Вирус гепатита В человека |
вирусы |
|
Авигепаднавирусы |
Вирус гепатита В уток |
РНК-вирусы |
|||
Ретровирусы |
|
Ал ьфаретро вирус ы (морфология вирионов С-типа) |
Вирус лейкоза птиц |
|
|
Бетаретровирусы (морфология вирионов В и Д-типа) |
Вирус опухоли молочной железы мышей |
|
|
Гаммаретровирусы (морфология вирионов С-типа) |
Вирус лейкемии мышей |
|
|
Дельтаретровирусы (морфология вирионов С-типа). Вирус лейкоза К PC и Т-лимфотропные вирусы человека и обезьян. |
Вирус лейкоза крупного рогатого скота |
|
|
Эпсилонретровирусы (ретровирусы рыб; морфология вирионов С-типа) |
Вирус дермальной саркомы окуневых рыб |
|
|
Лентивирусы (вирусы иммунодефицита человека и животных; вирио- ны цилиндрической или конической формы) |
Вирус иммунодефицита человека 1 |
|
|
Спумавирусы |
Пенящий вирус обезьян |
Реовирусы |
|
Ортореовирусы |
Ортореовирус млекопитающих |
|
|
Орбивирусы |
Вирус синего языка овец |
|
|
Ротавирусы |
Ротавирус А |
|
|
Колтивирусы |
Вирус колорадской клещевой лихорадки |
|
|
Аквареовирусы |
Реовирусы рыб А |
Семейство |
Подсемейство |
Род |
Типовой вид |
Бирнавирусы |
|
Авибирнавирусы |
Вирус бурсальной болезни птиц |
|
Аквабирнавирусы |
Вирус некроза поджелудочной железы лососевых рыб |
|
Парамиксо- вирусы |
Парамиксо- вирусы |
Респировирусы |
Вирус Сендай |
|
Морбилливирусы |
Вирус кори |
|
|
Рубулявирус |
Вирус паротита |
|
|
Возможно новый вид |
Австралийский морбилливирус лошадей |
|
Пневмо вирусы |
Пневмовирусы |
Респираторно-синцитиаль- ный вирус человека |
|
|
Метапневмовирусы |
Вирус ринотрахеита индеек |
|
Рабдовирусы |
|
Везикуловирусы |
Вирус везикулярного стоматита Индиана |
Лиссавирусы |
Вирус бешенства |
||
Эфемеровирусы |
Вирус эфемерной лихорадки крупного рогатого скота |
||
Новирабдовирусы |
Вирус некроза гемопоэти- ческой системы рыб |
||
Филовирусы |
|
Марбург-подобные вирусы |
Вирус Марбурга |
Эболаподобные вирусы |
Вирус Эбола |
||
Борнавирусы |
|
Борнавирусы |
Вирус болезни Борна |
Ортом иксо- вирусы |
|
Грипп А |
Вирус гриппа А |
Грипп В |
Вирус гриппа В |
||
Грипп С |
Вирус гриппа С |
||
Тоготовирусы |
Вирус Тогота |
||
Буньявирусы |
|
Буньявирусы |
Вирус Буньямвера |
Хантавирусы |
Вирус Хантаан |
||
Наировирусы |
Вирус болезни Найроби овец |
||
Флебовирусы |
Вирус лихорадки долины Рифт |
||
Аренавирусы |
|
Аренавирусы |
Вирус лимфоцитарного хориоменингита |
Корона- вирусы |
|
Коронавирусы |
Вирус инфекционного бронхита кур |
Торовирусы |
Вирус Берне |
Семейство |
Подсемейство |
Род |
Типовой вид |
Артери- вирусы |
|
Артеривирусы |
Вирус артериита лошадей |
Пикорна- вирусы |
|
Энтеровирусы |
Полиовирус человека 1 |
Риновирусы |
Риновирус человека 1А |
||
Гепатовирусь! |
Вирус гепатита А человека и обезьян |
||
Кардиовирусы |
Вирус энцефаломиокардита |
||
Афтовирусы |
Вирус ящура 0 |
||
Парэховирусы |
Парэховирус человека |
||
Клицивирусы |
|
Везивирусы |
Вирус везикулярной экзантемы свиней |
Лаговирусы |
Вирус геморрагической болезни кроликов |
||
Норволк-подобные вирусы |
Вирус Норволк |
||
Саппоро-подобные вирусы |
Вирус Саппоро |
||
Астровирусы |
|
Астровирусы |
Астровирус человека |
Флавивирусы |
|
Флавивирусы |
Вирус желтой лихорадки |
Пестивирусы |
Вирус диареи крупного рогатого скота |
||
Гепацивирусы |
Вирус гепатита С |
||
Тогавирусы |
|
Альфавирусы |
Вирус Синдбис |
Рубивирусы |
Вирус краснухи |
||
Нодавирусы |
|
Бетанодавирусы |
Вирусы некроза нервной ткани морских рыб |
«Плавающий» род Дельтавирусы |
Вирус гепатита Дельта |
||
«Плавающий» род вирусов, подобных | вирусу гепатита Е |
Вирус гепатита Е |
Семейство |
Вирион |
Нуклеокапсид |
Геном |
|||
Диаметр (нм) |
Обо- лом ка |
Симметрия |
Структурных субъединиц |
Природа (конформация, кол- во сегментов) |
Размер (тн, тпн) |
|
Вирусы оспы |
250x200x200 |
+ |
сложная |
ни? |
дц, линейная |
170-250 |
Асфаровирусы |
175-215 |
+ |
икосаэдр |
gt;1892 |
дц, линейная |
170-190 |
Иридовирусы |
130-300 |
+ |
икосаэдр |
1892 |
дц,линейная |
150-350 |
Герпесвирусы |
150 |
+ |
икосаэдр |
162 |
дц,линейная |
125-235 |
Аденовирусы |
80-100 |
- |
икосаэдр |
252 |
дц,линейная |
36-44 |
Полиома- в и русы |
45 |
— |
икосаэдр |
72 |
ДЦ, циркулярная |
5 |
Папиллома- вирусы |
55 |
— |
икосаэдр |
72 |
ДЦ, циркулярная |
8 |
Парвовирусы |
25 |
— |
икосаэдр |
32 |
ОЦ(-), линейная |
5 |
Цирковирусы |
17-22 |
— |
икосаэдр |
32 |
оц(+), циркулярная |
1,7-2,3 |
Гепадна- вирусы |
42 |
— |
икосаэдр |
9 |
дц, циркулярная |
3,2 |
Ретровирусы |
80-100 |
+ |
икосаэдр |
? |
оц(+), линейная |
7-11 |
Реовирусы |
60-80 |
|
икосаэдр |
92 |
дц, линейная, 10, 11 или 12 сегментов |
16-27 |
Бирнавирусы |
60 |
— |
икосаэдр |
92 |
дц, линейная, 2 сегмента |
7 |
Парамиксо- вирусы |
150-300 |
+ |
спиральная |
ни |
оц(-), линейная |
15-16 |
Рабдовирусы |
180x75 |
+ |
спиральная |
ни |
оц(-), линейная |
13-16 |
Филовирусы |
790-970x80 |
+ |
спиральная |
ни |
ОЦ(-), линейная |
19 |
Борнавирусы |
50-60 |
+ |
икосаэдр |
? |
оц(-), линейная |
8,9 |
Ортомиксо- вирусы |
80-120 |
+ |
спиральная |
ни |
оц(-), линейная, 6, 7 или 8 сегментов |
10-13,6 |
Буньявирусы |
80-120 |
+ |
спиральная |
ни |
оц(—), линейная, 3 сегмента |
11-21 |
Аренавирусы |
100-300 |
+ |
спиральная |
ни |
оц(—), линейная, 2 сегмента |
10-14 |
Семейство |
Вирион |
Нуклеокапсид |
Геном |
|||
Диаметр (им) |
Обо лоч ка |
Симметрия |
Структурных субъединиц |
Природа (конформация, кол- во сегментов) |
Размер (ти, тпи) |
|
Корона- вирусы |
80-220 |
+ |
спиральная |
ни |
оц(+), линейная |
20-32 |
Артеривирусы |
50-70 |
+ |
икосаэдр |
ни |
оц(+), линейная |
15 |
Пикорна- вирусы |
28-30 |
|
икосаэдр |
60 |
оц(+), линейная |
7,2-8,4 |
Калици- вирусы |
30-38 |
— |
икосаэдр |
32 |
оц(+), линейная |
7,4-7,7 |
Астровирусы |
28-30 |
- |
икосаэдр |
32 |
оц(+), линейная |
7,2-7,9 |
Тогавирусы |
70 |
+ |
икосаэдр |
60 |
оц(+), линейная |
9,7-11,8 |
Флавивирусы |
45-60 |
+ |
икосаэдр |
? |
оц(+), линейная |
9,5-12,5 |
Нодавирусы |
36-43 |
+ |
? |
? |
оц(-), циркулярная |
1,7 |