Основными критериями включения белков в суперсемейство являются доменная организация молекул и статистически достоверная гомология с известными иммуноглобулинами. Как уже
Молекулы суперсемейства иммуноглобулинов
Таблица 5.1
Рис. 5.1. Доменная организация членов суперсемейства иммуноглобулинов.
CD1, CD2, CD4, CDS, CTLA 4, MRC 0X2 — маркеры Т-клеток, LFA3 — адгезивный белок клеток, Fc72b/ylR — рецептор к Ig2b и IgGl на макрофагах, Poly-lgR — рецептор эпителиальных клеток кишечника и печени, обеспечивающий транспорт JgM и IgA через эпителий, MAG — белок миелина, NCAM — белок нейронов, глии и клеток эмбрионов раннего периода развития, СЕА — маркер эпителиальных клеток и их опухолей, CSF 1R — рецептор к колониестимулирующему фактору, а1В — гликопротсин сыворотки крови, LINK — белок сцепления, соединяющий прогеогликан с гиалуроновой цепью
отмечалось (глава 2), каждый домен, входящий в состав иммуноглобулина, представляет собой двухслойное молекулярное образование, построенное по принципу нескольких антипараллельных Р-структур, стабилизированных -S-S- связями. V-Домен имеет че-
тыре р-структуры в каждом слое и один дополнительный р-сег- мент, соединяющий два молекулярных слоя; 65-75 аминокислотных остатков домена данного типа составляют участок полипеп- тидной цепи, ограниченной цистеиновым мостиком. У С-домена имеется четыре [3-структуры в одном слое и только три — в другом. Число аминокислотных остатков, ограниченных цистеиновой связью, равно 55-60 (см. также гл. 2 и 3).
Таким образом, для включения анализируемого домена в состав суперсемейства необходимо установить сходство его пространственной организации с V- или С-доменами иммуноглобулинов.
Вторым критерием для включения анализируемого белка в состав суперсемейства служит гомологичность его аминокислотной последовательности иммуноглобулинам. Все изученные к настоящему времени домены по степени гомологии различным доменам иммуноглобулинов делятся на три группы: V, С1 и С2. Группа V включает вариабельные домены изотипов иммуноглобулинов и антигенраспознающих Т-клеточных рецепторов. Кроме того, такие белки суперсемейства, как корецепторы Т-клеток — CD4 и CD8, Poly-IgR, СЕА, MRC OX-2, LINK имеют в своей структуре домены V-ipyrniu. Для понимания эволюции суперсемейства иммуноглобулинов следует особо подчеркнуть, что однодоменные белки Thy-1 и Р0 также входят в V-группу.
С1-группа объединяет домены константной части иммуноглобулинов, С-домены Т-клеточного рецептора и молекул I и II классов МНС. К этой же группе относится однодоменный белок 32-м — один из предковых белков всего суперсемейства
В С2-группу входят домены полипептидов с адгезивными и рецепторными свойствами.
Молекулы суперсемейства иммуноглобулинов
Таблица 5.1
Категория |
Число аминокислотных остатков |
Вид |
Иммуноглобулины: |
|
|
Н-цепь (IgM) |
572 |
мыть |
L-цепь у-типа |
214 |
то же |
L-цепь Х-типа |
213 |
- * - |
Т-клеточвый рецепторный (ТКР) комплекс: ТКР: |
|
|
а-цепь |
250 |
- * - |
р-цепь |
282 |
- * - |
у-цепь |
286 |
- * - |
CD3: |
160 |
|
у-цепь |
человек |
|
5-цепь |
150 |
то же |
Е-цепь |
185 |
- * - |
Главный комплекс гнстосовместнмосгж: класс I: |
|
|
Н-цепь |
339 |
- « * |
р2 -микроглобулин |
339 |
- * - |
класс JJ: |
|
|
а-цепь |
229 |
- * - |
0-цепь |
237 |
- * - |
Антигены, связанные с рг-мнкроглобулииом: |
|
|
TL, Н-цепь |
335 |
мышь |
Qa, Н-цепь |
313 |
то же |
СВ1а, Н-цепь |
311 |
человек |
Адгезивные молекулы Т-клеток: |
|
|
CD2 |
322 |
крыса |
LFA-3 |
207 |
человек |
Днфференцировочяые кяткгены субпопуляций Т-клеток: |
|
|
CD4 |
435 |
человек |
CDS |
210 |
крыса |
CTLA4 |
188 |
мышь |
Аятнтены мозга и лнмфондной ткжнв: |
|
|
Thy-1 |
111 |
крыса |
MRC ОХ 2 |
248 |
то же |
Иммуноглобулиновые рецептары: |
755 |
|
Poly lgR |
кролик |
|
Fcy2b/ylR |
351 |
мышь |
Молекулы нервной ткянн: |
1072 |
|
адгезивная молекула нервной ткани |
курица |
|
(NCAM) |
610 |
|
гликопротеин миелина (MAG) |
крыса |
|
Р0 белок миелина |
219 |
то же |
Опухолевый антиген: |
668 |
|
карий но-эмбриональный антиген |
человек |
|
Рецепторы к ростовым факторам: |
|
|
к фактору тромбоцитов (PDCF) |
1067 |
мышь |
к колониестимулирующему фактору-1 |
953 |
человек |
(CSF1R) Молекулы, ве связанные с клеточной поверхностью: |
|
|
ai В-гликопротеин |
474 |
то же |
белок сцепления (LINK) |
339 |
крыса |
Рис. 5.1. Доменная организация членов суперсемейства иммуноглобулинов.
CD1, CD2, CD4, CDS, CTLA 4, MRC 0X2 — маркеры Т-клеток, LFA3 — адгезивный белок клеток, Fc72b/ylR — рецептор к Ig2b и IgGl на макрофагах, Poly-lgR — рецептор эпителиальных клеток кишечника и печени, обеспечивающий транспорт JgM и IgA через эпителий, MAG — белок миелина, NCAM — белок нейронов, глии и клеток эмбрионов раннего периода развития, СЕА — маркер эпителиальных клеток и их опухолей, CSF 1R — рецептор к колониестимулирующему фактору, а1В — гликопротсин сыворотки крови, LINK — белок сцепления, соединяющий прогеогликан с гиалуроновой цепью
отмечалось (глава 2), каждый домен, входящий в состав иммуноглобулина, представляет собой двухслойное молекулярное образование, построенное по принципу нескольких антипараллельных Р-структур, стабилизированных -S-S- связями. V-Домен имеет че-
тыре р-структуры в каждом слое и один дополнительный р-сег- мент, соединяющий два молекулярных слоя; 65-75 аминокислотных остатков домена данного типа составляют участок полипеп- тидной цепи, ограниченной цистеиновым мостиком. У С-домена имеется четыре [3-структуры в одном слое и только три — в другом. Число аминокислотных остатков, ограниченных цистеиновой связью, равно 55-60 (см. также гл. 2 и 3).
Таким образом, для включения анализируемого домена в состав суперсемейства необходимо установить сходство его пространственной организации с V- или С-доменами иммуноглобулинов.
Вторым критерием для включения анализируемого белка в состав суперсемейства служит гомологичность его аминокислотной последовательности иммуноглобулинам. Все изученные к настоящему времени домены по степени гомологии различным доменам иммуноглобулинов делятся на три группы: V, С1 и С2. Группа V включает вариабельные домены изотипов иммуноглобулинов и антигенраспознающих Т-клеточных рецепторов. Кроме того, такие белки суперсемейства, как корецепторы Т-клеток — CD4 и CD8, Poly-IgR, СЕА, MRC OX-2, LINK имеют в своей структуре домены V-ipyrniu. Для понимания эволюции суперсемейства иммуноглобулинов следует особо подчеркнуть, что однодоменные белки Thy-1 и Р0 также входят в V-группу.
С1-группа объединяет домены константной части иммуноглобулинов, С-домены Т-клеточного рецептора и молекул I и II классов МНС. К этой же группе относится однодоменный белок 32-м — один из предковых белков всего суперсемейства
В С2-группу входят домены полипептидов с адгезивными и рецепторными свойствами.